海洋科学与技术学院是我校最早实现本科、研究生多层次教育的教学科研单位。始建于2000年，其前身为我校海洋科学系。十多年来，学院紧密结合国家及地方的海洋战略，开展海洋科学与技术领域的科学研究与人才培养，取得了跨越式发展。目前学院人才梯队合理，学科平台完善，科研力量强劲，主干学科海洋科学在2016年度教育部一级学科评估中排前5名，2019年海洋科学专业入选首批国家级一流本科专业建设点，成为我国海洋科技创新和人才培养的重要支撑力量。
学院现有教职工90余人，其中从事科研教学工作一线教师72人，拥有高级职称人员46人，占科研教学人员的63%；拥有博士学位教师62人，占科研教学人员的86%。现有双聘（兼职）院士4人，国家级特聘专家1人，新世纪百千万人才2人，教育部新世纪优秀人才支持计划3人，钱江学者特聘教授2人，浙江省“151人才工程”第二层次2人，浙江省本科高校中青年学科带头人4人，聘有物理海洋学国际知名教授4人，初步形成了一支梯队合理、专业素质过硬、技术力量较强的师资队伍。
学院始终将学科建设、科学研究和人才培养作为学院发展的首要任务。海洋科学是浙江省一流学科A类，学科拥有“国家海洋设施养殖工程技术研究中心”和“海洋生物种质发掘与利用国家地方联合工程实验室”2个国家级科研平台以及“浙江省海水养殖装备与工程技术重点实验室”、“浙江省海洋增养殖工程技术研究中心”、“浙江省海洋科技创新服务平台”和“浙江省海洋生物种质发掘与利用工程实验室”等4个省级科研平台，拥有浙江省教育厅“极端海洋过程对海洋生态环境灾害的影响”和浙江省科技厅“海水养殖重点科技创新团队”2个创新团队，建有“海洋设施养殖工程技术”2011省级协同创新中心，建有1个博士后科研工作点、2个院士工作站。
学院主持“十三五”国家重点研发计划、国家863计划、国家科技支撑计划、国家自然科学基金、重大国际合作计划项目及课题70余项，其中科技部“十三五”国家重点研发计划项目1项，国家科技支撑项目2项，国家自然科学基金委重点项目1项，国家自然科学基金委共享航次项目1项；在主要研究领域取得了一批重大成果，获国家科技进步二等奖1项，省部级一等奖5项、二等奖13项。在海洋动力灾害及对生态环境影响、海水养殖设施工程与装备、海洋生物资源发掘与利用和海洋生态环境修复与治理等领域取得重要突破，在气候与海平面变化及其影响、深水网箱研发、石首鱼科鱼类、海洋头足类育种及增养殖、海域价值评估等研究方向走在国内前沿，形成了显著的特色方向优势。
学院下设海洋科学、生物科学、环境科学3个系，拥有海洋科学、海洋技术、生物科学和环境科学与工程4个本科专业，以及海洋科学一级硕士点（包括物理海洋学、海洋化学、海洋生物学和海岛开发与保护4个二级硕士点）和设施农业专业硕士点。已实现本、硕双层次培养，其中海洋科学和生物科学是浙江省重点建设专业，海洋科学专业是国际化试点专业，海洋技术为浙江省优势专业，上述专业均依托浙江省一流学科A类（海洋科学）学科建设。在本科教学方面获国家级教学成果二等奖1项，省级教学成果二等奖2项。近十年来，学院先后为社会培养优秀本科毕业生2000多名，硕士毕业生200多名，联合培养博士研究生10余名。本科和研究生一次性就业率平均达到95%以上，就业专业相关度达到60%以上；本科考研平均录取率达到30%以上，特别是海洋科学专业考研平均录取率达到50%左右，且30%以上的学生被双一流高校录取，为海洋领域培养了大量优秀人才，为国家和地方海洋经济战略的实施提供了重要支撑。此外，学院与意大利比萨大学、俄罗斯国立湖河渔业研究所、日本东京海洋大学、澳大利亚塔斯马尼亚大学、台湾海洋大学等30多所境外高校和科研院所建立了长期合作关系，为本学院人才培养的国际化奠定了良好的基础，浙江海洋大学比萨海洋研究生学院的成立为我院国际化人才培养的拓展和深化提供了重要支撑。本学院已成为我国海洋领域高端人才重要的培养基地。