重庆医科大学基础医学院始建于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学上海医学院）抽调100多名基础医学师资组建而成，原名基础医学部，1996年更名为基础医学院。学院历经60余年的建设与发展，在师资队伍、教学改革、科学研究、学科建设、人才培养、对外交流等方面均取得了长足发展，并跃入全国基础医学前列。

科室介绍
现有基础医学院办公室、基础医学院教务科以及人体解剖学、生理学、病原生物学、组织学与胚胎学、病理解剖学、病理生理学、免疫学、法医学、放射医学、生物化学与分子生物学、细胞生物学与遗传学、生物信息学共12个教研室。
师资队伍
现有教师162人，其中教授46人，副教授57人，讲师59人。博士生导师18人，硕士生导师61人，博士学位占59.9%，硕士学位占30.2%，具有出国留学经历占31.5%。有国务院特殊津贴专家6人，全国优秀教师1人，教育部新世纪优秀人才资助计划3人，国家教育部首批骨干教师2人，省部级有突出贡献中青年专家2人，重庆市杰出青年基金获得者1人，重庆市“教育工作终身贡献奖“获得者1人，重庆市优秀教师3人，重庆市名师2人，重庆市学术技术带头人10人及学术技术带头人后备人选6人，重庆市高校优秀人才资助计划4人，重庆市“322”工程第一层次人选1人，重庆市高校首批青年骨干教师资助计划4人，重庆市优秀人才支持计划1人，重庆市高等学校优秀中青年骨干教师资助计划16人。国际体视学会副主席1人，国家一级学会常务理事及理事9人，省级学会理事长、副理事长以及专委会主任委员和副主任委员11人。
学科建设
现有基础医学一级学科博士点、基础医学博士后科研流动站、基础医学一级学科硕士点、生物学一级学科硕士点；基础医学现为重庆市第一批一流学科。学院的神经科学与认知科学学科为ESI全球排名前1%的学科；基础医学和生物学现为重庆市市级重点学科；重庆市基础医学科研创新团队1个，重庆市神经科学重点实验室1个，重庆市刑事侦查技术工程研究中心1个，重庆市临床病理医疗质量控制中心1个；国家卫生部病理远程会诊试点省级中心；重庆市病理专科医师培训基地。
教学工作
承担了全校40余个专业（或专业方向）本科生、留学生和研究生的公共基础与医学基础教学任务，开设理论课程80余门，实验课程300余门。教学工作量占全校教学计划的35%。课余时间指导120余名本科生，获全国大学生挑战杯、全国基础医学实验设计大赛及创新论坛和全国大学生数学建模比赛一、二等奖20余项。
教学改革与研究
学院以转变教学观念，更新教学思想为先导，以保证和提高教学质量为生命线；以课程体系改革为主题；以改革教学方法为手段，以推动医学基础医学教学水平的不断提升。近年来获得重庆市教改重大项目、重点项目、面上项目20余项，获重庆市教学成果一等奖、二等奖5项，发表教学改革论文200余篇，主编国家规划教材50余部。 教学质量工程建设：现有：“国家级基础医学实验教学示范中心”1个；国家级虚拟仿真实验教学中心1个；病理学、组织胚胎学和病理生理学3门市级精品课程；病理学、生物化学与分子生物学2门研究生市级精品课程；生物化学、法医学、放射医学、生理学、人体解剖学、分子生物学6门校级精品课程。基础医学和法医学专业获得特色学科专业。
科学研究
现有神经科学研究中心、分子医学与肿瘤研究中心、干细胞与组织工程研究室、法医学与生物医学信息研究室、发育生物学研究室等6个科研平台。近5年，学院获得国家自然科学基金课题90余项，国家科技部、教育部、卫生部、国家新药基金、联合国儿童基金会、重庆市科委及教委等各级课题200余项，获得省部级科技进步奖20余项，国家发明专利12项，年均发表论著290余篇，其中35%的论著被SCI收录，单篇最高影响因子24.892。学院纳米医学创新团队被共青团中央、全国青年、全国学联和全国少工委授予大学生“小平科技创新团队”称号（全国仅50个）。
人才培养
学院每年招收博士研究生20-25名，硕士研究生100余名，并招收基础医学、法医学、生物信息学和医学实验技术专业本科生，年均160余名,已累计培养研究生和本科生4000余人。
对外交流
学院注重智力引进、对外交流和青年师资培养。近5年，学院聘请来自美国、加拿大等国的4名外籍专家为学院兼职教授，并与国内外10余所大专院校和科研院所开展了项目合作和建立了师资培养协议，每年选送5-8名教师赴国外相关院校和实验室进修学习，支持30余人次教师外出参加各类学术交流会。