环保产业是战略性新兴产业，环境保护是我国的基本国策，生态文明建设是当前及今后长时期的国家需要，环境科学与工程专业应国家的战略需要而设立，有着广阔的前景和坚实的成长基础。本专业的定位与我校的办学定位相一致，致力于培养高级应用型人才。立足胶东，为山东企事业单位培养环保管理和技术人才，包括污染治理、清洁生产、生态规划、环境评价、环境规划技术人员；面向全国，为高等院校、科研院所输送优秀人才。  
环境科学与工程专业办学条件较好，师资力量强，基础实验室及仪器设备基本满足需求；2006年获批环境科学硕士点；2011年入选烟台大学特色专业；2013年入选山东省名校建设工程；2016年入选山东省高水平应用型大学建设学科群专业；拥有“山东省环境保护室内环境重点实验室”和“山东省空气净化工程技术研究中心”。其中，“山东省空气净化工程技术研究中心”被中国科协工程学会联合会室内环境委员会确定为四大工作站之一。  
为了适应形势发展的需要，环境科学与工程专业目前下分4个方向：  
（1）污染控制工程：是传统的环境工程特色方向，突出环境污染的防治技术与方法，重点学习和掌握废水处理及其再利用技术、大气污染的防治措施、固体废弃物的处理与资源化再利用技术、物理性污染的内容和有关防治措施。这一方向是传统的环境污染末端治理的典型代表，但也是目前环境污染治理中不可缺少的基本途径。  
（2）环境安全工程：为适应环境科学与工程的最新发展需要而设立。与传统的末端治理不同的是，借助清洁生产的理念，从源头入手，着眼于整个工艺过程，将污染消除在生产过程中，以实现环境的可持续发展。重点学习和掌握环境污染原理、清洁生产流程、安全与卫生知识，以及碳排放与碳交易的相关内容，树立不同于末端治理的环境保护理念，为环境的良性发展创造有利条件。  
（3）环境规划与管理：是传统的环境科学的重要分支，也是环境工程的重要方向，是环境学科的主要专业之一。环境问题的解决不能完全依靠工程技术手段已经成为社会共识。本方向重点学习和掌握如何从规划、管理、经济、政策、技术等角度，应用3S等先进信息获取处理技术、系统科学方法，和环境经济理论方法来解决环境问题，主要针对流域、区域、全球的环境问题。  
（4）环境生态工程：为适应新形势下生态文明建设的需要，满足环境保护人才的最新需求而设立。与传统的利用物理的与化学的方法和手段不同的是，利用生态的方式开展环境污染治理与环境整治具有先天的优势。伴随着新的本科专业目录的颁布，环境生态工程成为环境科学与工程类的一个主要专业，这一方向的设立也顺应了时代的发展。本方向重点学习和掌握环境污染的原理、环境生态的基础知识、环境生态工程的基本理论和方法，从而学会利用环境生态工程有效地解决当前的各种环境问题。