广州中医药大学于1973年开办中药学专业，1984年成立中药系，1997年更名为中药学院，是国内最早创立专门培养中药学高级人才的院系之一。
中药学院用于科教的总面积约4.4万平方米，其中本科教学用场地近3万平方米。学院有中药学国家级实验教学示范中心1个，国家中药现代化工程中心1个，教育部国际联合实验室1个，广东省重点实验室2个，广州市重点实验室1个。仪器设备总值近1.5亿元。近5年里，学院承担国家和省部级科研190余项，累计科研经费1.3亿元，以第一或通讯作者发表SCI论文367篇，获国家专利47项，参获国家科学技术进步奖二等奖1项，广东省科学技术奖励一等奖1项，其他省部级科学技术奖励4项。药理学和毒理学学科进入ESI全球排名前1%。
学院现实行学部管理与运行体制。下设中药资源学学部、药物化学学部、药理学与方药学学部、药剂学学部。共有教职工161人，其中正高51人，副高47人，中级职称31人。其中，博士学位74人，硕士学位47人。有博士生导师32人，硕士生导师84人，长江学者讲座教授2人，海外杰青1人，国家级百千万人才1人，全国中药传统特色技术传承人3人，享受政府特殊津贴专家2人，珠江学者特聘教授1人，广东省特支计划“百千万工程领军人才”1人，广东省“千百十工程”国家级培养对象1人，青年珠江学者1人，广东省“杰青”2人，广东省高等学校优秀青年教师培养计划培养对象2人，“千百十工程”省级培养对象6人，广州市珠江科技新星6人。学院与美国等海外20多所知名大学建立了学术交流与合作关系，先后兼职引进国外知名教授12名，全职引进海外优秀人才19名。
学院在45年的办学历程中，逐步形成了本科、硕士、博士多层次的人才培养体系。拥有中药学一级学科学士、硕士和博士学位授权点，药学一级学科学士和硕士学位授权点，中药学专业学位硕士授权点，学院也是中药学博士后科研流动站。中药学院被学校纳入中医学双一流学科群建设单位。中药学和药学学科是学校高水平大学建设的2个重点建设学科。药学学科进入广州市重点学科建设行列。此外，中药药剂学、中药药理学和临床中药学是国家中医药管理局重点学科。目前，学院共有全日制在校博士研究生44人，硕士研究生305人。
学院始终秉承卓越全人教育的理念，狠抓本科教育质量。现有中药学、药学、制药工程、中药资源与开发四个专业，在校本科生2055人。在全院师生的共同努力下，中药学专业和制药工程专业为“国家特色专业”和“广东省名牌专业”，中药制药专业为“国家战略性新兴产业相关本科专业”，中药资源与开发专业为“广东省名牌专业”。学院建立了教学实践基地49个，产学研合作基地31个。2018年开始，学院实施中药学和药学大类招生，优化专业设置，现设有中药学、药学和制药工程3个专业。中药学专业在二年级分化为中药学、中药资源与开发专业和药品经营与管理专业方向。