重庆交通大学开办航海类、船舶类专业迄今已有近60多年历史，培养了2万余名各层次毕业生，遍及我国各大航运与船舶企事业单位。学校2006年12月成立航海学院，2015年5月更名为航运与船舶工程学院，经过多年的建设与发展，航运与船舶工程学院已成为我国西部地区一流的高等航海和船舶教育基地。
学院现有教职工72人，其中教授、副教授18人，硕士生导师30人，具有高级工程师、高级轮机长、注册验船师、工程师、甲类船长、甲类轮机长等适任证书的双师型教师27人。外聘专家、教授12人。
学院开办有船舶与海洋工程、轮机工程、航海技术、船舶电子电气工程4个普通本科专业，其中“船舶与海洋工程”是重庆市高等学校“三特行动计划”特色专业、重庆市高等学校“船舶工程”特色学科专业群核心专业，“轮机工程”、“航海技术”是国家“卓越工程师教育培养计划”专业和重庆市高等学校“船舶工程”特色学科支撑专业群专业，“船舶电子电气工程”是重庆市高等学校“船舶工程”特色学科专业群支撑专业。
学院拥有船舶与海洋工程重庆市重点学科和船舶与海洋工程一级学科专业学位硕士授权点，拥有“重庆市航海实验教学示范中心”、“重庆市航海类专业人才培养模式创新实验区”、“重庆市特种船舶数字化设计与制造工程技术研究中心”、“重庆市船舶工业产学研战略联盟”等4个省部级教学、科研与产学研合作平台，3个校级研究所。近年来，利用中央与地方共建优势特色学科专业实验室项目、交通运输部支持项目等渠道累计投入实验室建设经费8900余万元，建成了西部一流、国内先进的实验室，为学院可持续发展奠定了坚实基础。
作为重庆唯一一所获得国际认证的航海类、船舶类普通本科院校，学院坚持以社会需求为导向，按照“立足西部、依托长江、面向海洋”的办学定位，秉持“学以致用、求实创新” 的办学理念, 彰显“船航并重、海河并举”的办学特色，弘扬“海润有生，船行无限”的学院精神，大力传承创新航海文化、海洋文化。遵循国际海事公约和国家海事法规，培养适应现代航运业与造船业发展需要的高级技术人才，为我国航运和造船业的发展及重庆建设长江上游航运中心作出了突出贡献。