交通运输学院创办于1982年，前身为道路运输管理系，是重庆交通大学办学历史悠久的院（系）及学校交通特色的重要支撑。目前已具备从本科生、研究生到博士后完整的人才培养体系。现设有交通运输工程博士后流动站1个、交通运输工程一级学科博士和硕士授权点各1个，二级学科博士和硕士授权点各3个，一级学科专业学位硕士授权点1个；交通运输、交通工程、交通设备与控制工程、交通管理、汽车服务工程5个本科专业。学院建有1个重庆市重点学科，1个重庆市一流学科，3个重庆市重点实验室、1个重庆市实验教学示范中心、1个重庆市“智慧交通”众创空间。学院是“中国物流教学十大创新品牌院校”和“全国运输与物流院校教学示范基地”。
学院有教职工82人，其中专职教师61人，实验教师7人，专职政治辅导员6人，管理人员8人。有教授22人，副教授23人，博士生导师5人，具有博士学位37人。有重庆市“ 巴渝学者”特聘教授1人，交通运输部科技英才2人，“海外高层次人才引进计划”1人，海外巴渝引智计划3人，重庆市学术技术带头人及后备人选5人，中国公路学会道路工程分会副理事长1人，教育部专业教指委委员2人，教育部工程教育专业认证专家1人。有境外学习、工作及企业工作经历的教师30余人。在校本科生1900余人，博硕士研究生300余人，在站博士后10余人，其中外籍博士2人。
学院在交通系统规划、交通管理与控制、山区道路交通流理论及应用、交通信息系统、交通环境工程、智能交通系统、车辆节能及污染控制、交通与车辆安全等领域有较强的研究能力。近年来，先后承担了包括国家863计划项目、国家科技支撑计划、国家自然科学基金及省部级科研项目100余项，成果获国家、省部级科技奖10余项。一批高水平的科研成果被采用，为行业发展提供了有力支撑。
学院坚持“厚德崇学，和谐交通”的办学理念，注重教育教学改革与创新实践，教学与科研并举，着力学生实践创新能力的培养，每年承办“全国大学生交通科技大赛”、“全国大学物流设计大赛”和“全国大学生水运大赛”等品牌大赛。毕业生全国交通运输行业有着良好的社会声誉。