能源与动力工程系源自原新疆工学院电气工程系于1972年创立的电力系统及其自动化专业的有关讲授发电厂动力部分的课程组。由于新疆能源与动力工程专业人才奇缺，原新疆工学院的电气工程系有意增设该专业，并开始进行师资的培养和储备。1988年开始开办发电厂动力工程专业的专科教育。2000年新的新疆大学成立后，经过姜波、马盛骏、胡申华等教师的共同努力，2001年热能与动力工程专业正式成立，于当年开始招收普通高考的考生。2003年10月热能与动力工程教研室正式挂牌。经过近五年的发展与积累，2008年成立热能与动力工程系。同年，热能与动力工程专业被列为自治区重点产业紧缺专业后，2008年成立热能与动力工程系。2013年由于专业目录调整，专业名称变更为能源与动力工程。
能源与动力工程专业致力于能源的利用及开发，和如何更高效的利用能源。能源既包括水、煤、石油等传统能源，也包括核能、风能、生物能等新能源，以及未来将广泛应用的氢能，动力方面则包括内燃机、锅炉、航空发动机、制冷及相关测试技术。其所涉及的主体行业对整个国民经济和工程技术发展起着基础、支撑以及驱动力的作用，在工学门类中具有不可替代的地位。能源与动力工程学科是新疆培养从事动力工程、能源开发与利用、环境保护、能源利用系统及设备的优化等领域工程技术人才的重要基地，也是新疆高校最早一个从事动力工程及工程热物理学科和热能与动力工程专业教学科研的实体。自专业建立以来，共培养1200多名的本科毕业生，为新疆能源动力行业输送了大量合格的工程技术人才。
目前本专业现有教师10人，其中教授2人，副教授3人，讲师3人，助教1人，实验师1人。具有博士学位的3人，教师均具有硕士及以上学位。承担和完成了各级科研项目20多项，其中包括国家自然科学基金项目12项、省部级项目的资助4项，项目总经费700余万。
本专业方向注重学科交叉和培养学生的综合素质。通过力学理论（工程力学、流体力学）、热工学理论（工程热力学、传热学等）、电工电子学理论、自动控制理论等的学习，使学生掌握本专业必需的、系统的技术基础知识，接受现代动力工程师的基本训练；通过计算机控制系统、现代测试技术、流体机械原理、流体机械自动控制、CAD技术、多媒体应用技术等课程的学习和相关的技能训练，使学生具备从事能源动力工程、流体机械及其自动控制和相关方面的设计、运行、实验研究的基本能力；具备较强的自学能力、独立工作能力、创新意识和较高的综合素质。本专业通过宽口径的课程设置和有效的科研实践活动，为学生提供广阔的学习空间、培养学生创新精神、提升学生在专业领域分析问题和解决问题的工程实践能力，能够使学生具有良好的社会适应和竞争能力。
自专业建立以来，学生的分配一直供不应求。在此背景下，该专业被列入了自治区紧缺专业。毕业生可选择电力系统设计研究院所、火力发电厂、动力设备制造企业、空调制冷、能源化工、天然气及城市燃气输配、可再生能源开发、热力发动机及汽车工程、有关能源、环保方面的公司和政府管理部门以及高等院校科研院所、部队等机构从事有关的能源利用、清洁能源开发、电力生产及自动化、节能与环保、制冷与低温、空调与人工环境等相关的工程设计、产品研发、教学、制造、检测和策划等研究与管理工作。本专业成绩优秀者可以免试或通过考试进入研究生阶段继续深造。本专业毕业生深受社会各相关行业的欢迎。