学院成立于2001年2月，2014年4月由集美大学生物工程学院更名为集美大学食品与生物工程学院，前身为创办于1972年的厦门水产学院水产加工系，具有40多年的本科办学历史。
专业学科建设
学院设食品科学与工程、生物工程两个本科专业，其中食品科学与工程为省级特色专业及创新创业改革试点专业同时通过了IEET认证，并于2019年6月通过教育部工程教育专业认证。目前本科在校生901人；现有食品科学与工程和生物学两个一级学科硕士学位授权点，并设有农业硕士（食品加工与安全领域）和工程硕士（食品工程领域）两个专业学位授权点，在校硕士研究生250人（含在职硕士生）；2014年开始招收水产学水产加工方向博士研究生，2015年招收水产学水产加工方向博士后，目前博士生5人。形成了完整的人才培养体系和协调发展的办学格局。
师资队伍
学院现有专任教师62人，其中教授16人，副教授24人；具有博士学位的教师43人；海外留学访学经历人员25人。专任教师中具有高级职称教师占65％，具有博士学位教师占69％，有境外学习经历教师占40%。另聘“闽江学者”讲座教授4人、讲座教授2人。专任教师中，享受国务院政府特殊津贴专家1人，农业部现代农业产业技术体系岗位科学家1人，入选福建省“百千万人才工程”3人，福建省高校科技创新团队带头人1人，福建省教学名师1人，省青年五四奖章集体及个人2个，入选福建省科技创新领军人才1人，入选福建省青年拔尖创新人才1人，入选福建省高校新世纪人才支持计划5人，入选福建省高校杰出青年科研人才培养计划4人，入选厦门市拔尖人才2人。
学科平台
学院建有水产品深加工技术国家地方联合工程研究中心、海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心(集美大学共建基地)、国家红藻加工技术研发专业中心、国家级海洋食品加工与安全研究生实践教育示范基地；福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室、福建省食品微生物与酶工程重点实验室、福建省海洋功能食品工程技术研究中心、福建省生命科学基础教学示范中心、福建省海洋生物资源开发利用协同创新中心等教学科研平台。教学、科研仪器设备总数3700多台(套)，总价值7500多万元，为教学及科研提供了良好的工作条件。
科研能力
近五年，学院先后承担了国家自然科学基金项目、国家863、国家科技支撑计划、福建省科技计划、厦门南方海洋研究中心项目等200多项课题，取得了一批具有较高学术价值、应用价值的科研成果。研究方向紧密结合福建省的实际，并逐渐在水产品保鲜与加工、海洋生物资源开发利用、食品发酵工程、食品安全检测与控制、农副产品保鲜与加工等方面形成了一定的优势与特色。
食品科学与工程专业
本科，学制四年，授予工学学士学位
培养目标：培养具备扎实掌握食品科学、食品工程、食品质量管理与安全监控等方面的专业知识和实践技能；具备从事食品相关的科学研究、技术开发、工程设计、生产管理和品质控制，以及解决复杂食品工程问题的基本能力；具有良好的人文和科学素养、团队合作精神，具有食品相关行业的实践执行和领导管理的基本能力；具有良好的社会责任感和国际化视野，具有自主学习和终身学习的意识，以及服务社会的能力的人才。
培养要求：系统学习食品科学与工程的基础理论、基本知识和基本技能，获得科学研究、技术开发、质量管理等方法的训练，具有食品加工、保藏、资源综合利用、检验和质量管理等方面基本能力。
就业方向：毕业生可在食品加工与制造，食品原料与配料，食品物流与营销等企业，以及相关的研究所，大专院校和以食品产业为对象的经济管理，公共卫生，技术监督，商品检验和贸易等部门工作。
主要课程：有机化学，生物化学，微生物学，化工原理与设备，食品化学，食品营养与卫生学，食品分析与检验，食品工艺学，食品质量管理学。
生物工程专业
本科理工类学制四年授予工学学士学位
培养目标：本专业培养具有生物科学基本知识和较系统的生物工程原理及其产业化工程技术的基本理论及基本技能，能在生物技术及工程领域从事设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发的高级生物工程技术人才，同时也为研究生的培养输送合格人选。
培养规格：本专业学生主要学习微生物学、有机化学、生物化学、基因工程、化工原理等方面的基本理论和基本知识；进行细胞培养与选育、发酵工程、酶工程和生物制品制造工程等方面的专业训练；在生物产品的开发、生产、管理、工程设计和市场营销等方面具有基本工作能力；
熟悉与生物工业有关的方针、政策和法规，了解当代生物工业发展动态和应用前景。
毕业生的服务方向及适合的工作岗位：能够在科研机构或高校从事科研或教学工作，在医药、食品、农业、环保、园林等行业的企、事业单位和行政部门从事与生物技术有关的工作。
主要课程：有机化学、生物化学、微生物学、化工原理、细胞生物学、发酵工程与设备、生化工程、生物工艺学。
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