浙江中医药大学药学院始建于1986年，前身为中药系，1999年更名为药学系，2006年更名为药学院。1986年设立中药学专业，1994年设立中药学本科专业，2000年设立药物制剂专业，2001年设立药学专业，2003年设立食品科学与工程专业（2018年转设为食品卫生与营养专业），2011年设立中草药栽培与鉴定，共5个本科专业，在校全日制本科生1500余人。其中中药学专业为国家级特色专业、浙江省重点专业，并于2015年通过教育部专业认证；药学专业为浙江省新兴特色专业；药物制剂专业为浙江省重点建设专业。中药学学科为浙江省“重中之重”学科、浙江省一流学科（A类）、浙江省重点建设高校优势特色学科，药学学科为浙江省一流学科（B类），药理学与毒理学学科为ESI全球前1%学科；中药学教学团队为浙江省教学团队。
学院现设有浙八味、现代中药与健康产品、中药资源学等3个校级研究所；中药制剂与炮制、中药药理学等10个院级研究所和教研室。拥有中药学国家级实验教学示范中心建设点、药学省级实验教学示范中心和中药制剂实验室、中药资源工程学实验室等6个浙江省重点专项实验室；中药学、药学2个一级学科硕士点，有中药学博士点和中药学博士后科研工作流动站。经过30余年的建设与发展，药学院已逐步建成以中药学学科群为优势和特色，以药学和食品科学与营养学科群为基础和支撑，具有一定国际影响、国内知名的教学研究型学院。
学院现有教职员工132人，其中正高职称32人，副高职称30人，博士生导师17人，硕士生导师22人。拥有中国工程院院士1人、享受国务院特殊津贴专家2人、国家重点学科带头人1人、国家“优青”获得者1人、浙江省有突出贡献中青年专家1人、浙江省“QR”入选者2人、浙江省“钱江学者”特聘教授4人，浙江省“新世纪151人才工程”入选者14人，浙江省高校中青年学科带头人9人，二级教授2人、浙江省教学名师1人，全国优秀教师1人、浙江省优秀教师3人。