郑州大学医学院创始于1928年的国立中山大学医科，开启了河南医学高等教育的先河。1952年河南医学院独立建院，1958年学院迁至郑州，1984年更名为河南医科大学。2000年7月与原郑州大学、郑州工业大学合并组建新郑州大学。
2018年10月，学校成立医学院，医学院是学校领导下的教育管理综合单位，代表学校举办医学教育。对医学教育实行统一领导，进行统筹、规划、协调和管理，强化医学教育内部各要素的融合，加强基础与临床之间的有机联系。
所属的教学院系、教学平台包括：基础医学院、临床医学系（临床医学、麻醉学、医学影像学、医学影像技术）、口腔医学院、护理与健康学院、医学检验系、儿科医学系、康复医学系、临床技能中心、基础、临床实验教学平台等。
所属的科研机构、科研平台包括：医学科学院的转化医学中心、实验动物模型中心、学校设置的研究机构等；食管癌防治国家重点实验室；河南省（郑州大学）医药研究院；实验动物中心、基础医学研究中心。
附属医院包括：第一附属医院、第二附属医院、第三附属医院、第五附属医院、人民医院、附属儿童医院、华中阜外医院、附属肿瘤医院、附属郑州中心医院、附属洛阳中心医院。
现开设有基础医学、临床医学、儿科学、口腔医学、医学检验技术、医学影像学、麻醉学、康复治疗学、医学影像技术9个专业。临床医学专业是教育部首批卓越医生教育培养计划——“五年制临床医学人才培养模式改革”和“临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革”的试点高校，是河南省名牌专业。
现有基础医学、临床医学、护理学3个一级学科博士点、临床医学博士专业学位授权点、6个一级学科硕士学位授权点、3个硕士专业学位授权点、3个博士后科研流动站。临床医学为国家一流建设学科，临床医学、药理学与毒理学、生物学与生物化学学科、分子生物学与遗传学、神经科学与行为学ESI排名全球前1％，其中临床医学ESI排名进入全球前1.65‰。拥有省部共建食管癌防治国家重点实验室、互联网医疗系统与应用国家工程实验室、国家远程医疗中心、国家药品临床研究基地、细胞与基因治疗、癌症化学预防国际联合研究中心等国家级科研平台。近5年来，医学学科已承担国家级科研课题543项，省部级2728项。获省级以上科技奖励437项，其中获国家科技成果二等奖1项；获得授权专利477项，其中发明专利46项。在《Nature》《Nature Communications》《Gut》《Jama》等高水平期刊发表学术论文多篇。
拥有一支教学、医疗、科研水平较高、结构合理的人才队伍。其中，高级专业技术人员1387名。教师队伍中，有院士2人、特聘院士19人、长江学者2人、国家杰青5人、……计划2人、<>计划5人、国家级“百千万人才工程”人选9人、中原学者3人、享受国务院特殊津贴专家58人、享受河南省政府津贴19人。
办学条件优越，学校在主校区、医学院校区为医科办学配备了良好的物理空间和教学设施。建设有基础医学实验中心、临床医学实验中心和临床技能训练中心等三大实验教学平台。学校有医学图书馆12150平方米，馆藏图书20多万册，图书管理手段先进，信息化程度高。
注重大学生创新能力培养，鼓励本科生参加科研与创新训练项目。每年有一批大学生创新创业训练项目得到国家和学校支持，近5年来，共获得国家级项目130项，省级14项，校级558项。获美国大学生数学建模竞赛二等奖1人。第十二届“挑战杯”河南省大学生课外科技学术作品竞赛省级二等奖5人。国际大学生ICAN创新创业大赛（国家级）二等奖1人，全国大学生电工数学建模竞赛（国家级）二等奖1人。全国大学生英语竞赛国家级特等奖5人、一等奖3人、二等奖9人、三等奖31人。河南省第十二届大学生课外学术科技作品竞赛省级一等奖4人。获全国高等医学院校大学生临床技能竞赛特等奖1次，一等奖1次，二等奖2次等等。
国际办学特色鲜明。医学科学院获批为首批地方高校国家级“国际化示范学院”，院长尼克·莱蒙当选为中国工程院外籍院士。基础医学院是河南省教育国际化示范单位。近年来多批次选派医学本科学生赴美国短期访问学习。分别与美国、英国、德国、日本、瑞典、挪威、丹麦、澳大利亚、台湾等国家和地区的大学、研究所、医学院、医院等建立了合作与交流关系。近5年来共有150多名教师赴美国哈佛大学医学院、加拿大约克大学、芝加哥大学等研修。每年接收临床医学专业海外留学生约200多人，共有在校留学生1084人。
九十多年来，郑州大学医学院培养了以“感动中国”十大年度人物胡佩兰教授，我国眼内异物研究的奠基人、全国“十大最美医生”张效房教授，中国科学院阎锡蕴院士等为代表的4万余名优秀医学人才，为中部地区乃至全国的医疗卫生健康事业做出了巨大贡献。学生培养质量优秀。2018年临床医学专业毕业生参加临床执业医师资格考试的综合通过率为86.21%，高出片区13.37个百分点，高出全国11.92个百分点。
10家附属医院开放床位数3万余张，年门诊量突破2000万人（次），现有国家临床重点专科36个，省级医学重点（培育）学科139个，有6家医院分别入选国家疑难病症诊治水平提升工程和国家区域医疗中心创建单位，是河南省医学创新人才和高端人才培养的主要临床基地，发挥着重要的引领和示范作用。
展望未来，郑州大学医学院将紧紧围绕健康中国战略实施，进一步依托学校深厚的文化底蕴和综合性大学多学科优势，促进学科交叉融合，突出办学特色，坚持立德树人，推进教育教学改革，优化服务生命全周期、健康全过程的医学专业结构，改革创新，砥砺奋进，建设国内一流、国际知名的医学院，培养一流医学人才，服务健康中国建设。