历史沿革：云南农业大学食品科学与工程学科始建于80年代初期，隶属于云南农业大学动物科学技术学院畜牧兽医系。1987年开始招收专科；1989年招收本科；1995年成立食品科学部；2001年5月，在学校食品科学部与蜂学系的基础上，成立食品科学技术学院。
学科专业：目前学院有1个一级学科博士点：食品科学与工程；1个二级学科博士点：食品资源与营养工程；1个一级学科硕士点：食品科学与工程；4个二级学科硕士点：食品科学、农产品加工及贮藏工程、功能食品、营养代谢免疫学；2个专业学位硕士点：工程硕士食品工程领域、农业推广硕士食品加工与安全领域；4个本科专业：食品科学与工程专业、食品质量与安全专业、粮食工程专业和葡萄与葡萄酒专业。
师资队伍：学院现有专任教师49人，其中正高级职称12人，副高级职称15人；具有博士学位22人，硕士学位16人；博生导师3人，硕士生导师15人，外聘教师12人。全国师德标兵称号 1人、云南省有突出贡献专业技术人才称号1人，云南省中青年学术与技术带头人1人，“云岭产业技术领军人才” 1人，入选云南省中青年学术与技术后备人才培养对象1人，昆明市中青年学术和技术带头人后备人才1人，柔性引进长江学者1人，设立院士工作站1个。
人才培养：学院现有在校学生1101人，其中本科生954人、硕士研究生125人、博士研究生19人，留学生3人。在全国大学生“挑战杯”课外科技作品竞赛中，屡获佳绩，2次获国家级铜奖、5次获校级团体金奖、1次获校级团体银奖、1次获校级团体铜奖。在“红塔杯”云南大学生创业计划大赛中，获得一等奖1项，二等奖2项、 三等奖3项；云南高校青年学术科技节活动中获金奖1项、铜奖2项。在2015年中国“互联网+”大学生创业计划大赛中，获国家铜奖1项，2015年云南省“互联网+”大学生创业计划大赛中，获省级金奖1项、省级优胜奖2项；在2016“创青春”云南省大学生创业计划大赛中，获得金奖一项，银奖两项。
学科与队伍建设：学院立足云茶、云花（食用）、云腿、云乳、云果、云咖啡、辣木等特色食物资源，针对食品加工与安全的重大科学问题和关键技术开展研究，已形成了3个省级重点学科：省级重点学科——动物食品科学、省级优势特色重点建设学科——食品科学与工程、校级重点学科——农产品加工及贮藏工程；1个教育部重点实验：普洱茶学教育部重点实验室； 3个省级工程中心：云南省特优畜产品精深加工工程研究中心、云南省农产品加工工程技术研究中心、云南省茶深加工工程技术研究中心；1个省级协同创新中心和1个省级实验教学中心以及云南省食品安全管理学院等重要支撑平台，1个云南省高校重点实验室：食品加工与安全重点实验室；拥有云南省研究生教育创新联合培养基地1个和云南农业大学茶因子与茶功效研究省创新团队1个。根据学科发展需要，结合云南省资源优势、区位优势和民族文化优势设置“食品资源与营养健康”、“农产品加工与贮藏”、 “食品化学与营养代谢”、“食品安全与信息化”四个研究方向并组建了相应的研究团队。四个团队拥有教师58人，其中教授25人，博导9人，45岁以下70.7%，博士学位84.5%，10个月以上海外研修经历41.4%。
科学研究与社会服务：近五年来，学院承担科研项目160余项，其中，主持国务院综改办项目1项、863项目1项，国家“十一五”科技支撑项目1项，FAO项目1项，国家基金项目16项，省级及以上其他项目100余项，到位经费1.85亿元。发表学术论文150余篇，SCI/EI收录50余篇，出版专著和教材13部，申请发明专利25项，授权17项，获省科技进步特等奖1项、一等奖1项，二等奖2项、三等奖5项，云南省自然科学奖三等奖1项，云南省技术发明奖三等奖2项。产学研合作成效显著，与云南省大理州漾濞县政府、红河州墨江县政府、曲靖市师宗县政府、怒江州泸水县、昭通市等多个地州县开展合作，与多家企业签署合作协议，科技成果在省内推广应用产生直接经济效益165.85亿元，经济与社会效益民巨大。
学院坚持以人为本，特色立院、质量强院、服务社会的办学理念，立足边疆、服务云南、面向全国，辐射东南亚和南亚，为食品科学和食品业的发展提供了人才和科技支撑。

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