2004年起招收“动画”专业方向本科生，2005年起招收“数码艺术”方向研究生，2016年“动画”专业获批教育部新增备案本科专业。
动画专业融合“艺”与“术”，是文化与科技、内容与技术高度融合的艺术专业。专业主干课程包括《动画概论》、《动画运动规律》、《动画概念设计》、《分镜头脚本设计》、《影视特效与后期合成》、《实验动画创作》、《定格动画》、《三维动画设计》、《声音设计》、《动画短片创作》《动画史与优秀作品赏析》等。与其它学科交叉辅修：《艺术史》、《电影视听语言》、《剧本写作》、《表演基础》、《舞台美术设计》等。全面涵盖了动画片制作流程中的所有知识，注重审美的培养和艺术的熏陶，同时强调实践与创作的能力，可以适应动画公司、影视制作公司、游戏公司、广告公司、互联网公司、演艺公司等多种社会需求。
本专业实行严格教学管理，深入推进教学改革，形成了专业建设的鲜明特色：（1）强调具有深厚的戏剧性的动画故事内核。在动画专业课程建设中，注意发挥“戏剧与影视学”学科优势，引导学生将戏剧戏曲故事“化”为作品的基础元素。（2）以原创与实践相结合理念为指导。突出动画设计课程的原创性和实践性，要求学生具有编剧、导演、分镜等设计制作能力，加强动画编导、原画设计等能力培养。专业人才培养特色可概括为“教授动画编导的知识、学会动画设计的方法、掌握动画制作的工具、培养动画创新的精神。”
本专业拥有一批产学研一体化的试验基地，包括：“数字演艺集成创新文化部重点实验室”、“上海市多媒体演艺虚拟空间合成重点实验室”、“新媒体交互演艺中心”、“情境体验艺术中心”等，并成立“上海戏剧学院动画艺术中心”，一方面作为连接教学和产业的平台，促进产研结合，增进学生就业和适应社会需求的能力。另一方面作为国际动画艺术交流的平台，与国际艺术院校和科研机构接轨，举办专家讲座和工作坊，着力培养具有国际视野的动画艺术专业人才。