山东农业大学农学院导师陈翠霞
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山东农业大学农学院导师陈翠霞 正文
陈翠霞:女,泰山学者,教授, 博士、硕士研究生导师。
2002年由山东农业大学和中国科学院遗传所合作培养获得农学博士学位。2003年在北京生命科学研究所(NIBS)博士后研究;2004年赴美国堪萨斯州立大学(Kansas State University)博士后研究;2005年到伊利诺斯大学香槟分校(University of Illinois at Urbana-Champaign)生物系项目研究员;2008-2010年到新成立的伊利诺斯大学香槟分校-生物能源所(Energy Biosciences Institute)工作。以上工作主要包括 BAC文库的构建,分子标记开发和高密度遗传图谱的构建,芒草和甘蔗基因组序列和基因表达序列测定与分析,Papaya性别染色体性别决定区物理图谱构建,性别决定功能基因的分离,玉米南方锈病抗病基因的首次分子定位,小麦穗发芽和种子休眠QTL定位等基因组学方面的研究。近几年来,在Nature, Genetics, Theoretical Applied Genetics, Molecular Breeding, Genome, Moleculer Genetics Genomics, BMC genomics, 遗传学报,作物学报,植物病理学报等学术期刊上发表有关研究论文30余篇,参与编写著作一部,迄今已被国内外学术同行引用250余次。2003年获得山东省优秀博士论文奖。2010年4月入选山东省“泰山学者海外特聘教授”。
研究方向:能源植物如芒草、能源甘蔗、玉米等基因组学研究和分子改良。主要内容是利用现代分子生物学和新一代DNA测序技术,结合生物信息学、比较基因组学、分子遗传学等研究方法,进行几个方面的研究:①基因组遗传图谱和物理图谱的构建;②重要种质资源基因组基因表达序列测定和比较分析;③重要农艺性状、生物质组分相关基因及QTL的分子克隆和功能分析;④分子改良技术平台的建设和分子设计育种等。
科研项目:先后参与美国国家自然科学基金项目,美国农业部项目科研课题,能源巨头BP公司投资的生物质能源研究项目;曾主持山东省科委资助课题2项,参与国家“863”项目1项; 现正在主持国家国家自然基金委(NSFC)资助研究项目1项(2011-2013年,项目批准号:31071471)。
主要学术论文:
1.Ming, R., S. Hou, Y. Feng, Q. Yu, A. Dionne-Laporte, ··· C. Chen (the 15th author out of 85), ect. 2008. The draft genome of the transgenic tropical fruit tree papaya (Carica papaya Linnaeus).Nature 452:991-996. (Cover article).
2.Cuixia Chen, Qingyi Yu, Shaobin Hou, Yingjun Li, Moriah Eustice, Paul H. Moore, Robert E. Paull, Maqsudul Alam, Ray Ming. 2007.Construction of a Sequence-Tagged High Density Genetic Map of Papaya for Comparative Structural and Evolutionary Genomics in Brassicales.Genetics 177: 2481-2491.
3.Cuixia Chen, Shibin Cai, Guihua Bai. 2008. A maior QTL controling seed dormancy and pre-harvest sprouting resistance on chromosome 4AL in a Chinese wheat landrace.Molecular Breeding. 21(3):351-358.
4. C.X. Chen, Z.L.Wang, D.E. Yang, C.J. Ye, Y.B. Zhao, D.M. Jin, M.L. Weng. B. Wang. 2004. Molecular tagging and genetic mapping of the disease resistance gene RppQ to southern corn rust.Theor Appl Genet 108 (5): 945-950
5. Cuixia Chen, Kankshita Swaminathan, Brandon Smith, Brandon James, Dan Rokhsar, Matt E. Hudson, Steve P. Moose, Ray Ming. Genome survey sequences of sugarcane species.(In preparation)
6.Chunjiang Zhou, Cuixia Chen, Pengxiu Cao, Suowei Wu, Jianwei Sun, Demin Jin, Bin Wang. 2007. Fine mapping of RppQ, a resistance gene to southern corn rust in maize.Mol Genet Genomics 278: 723-728.
7.Jianping Wang, Cuixia Chen, Jong-Kuk Na, Qingyi Yu, Shaobin Hou, Robert E. Paull, Paul H. Moore, Maqsudul Alam, Ray Ming. 2008. Genome-Wide Comparative Analyses of Microsatellites in Papaya.Tropical Plant Biology.1:278–292
8.Andrea Blas, Qingyi Yu, Cuixia Chen, Olivia Veatch, Paul H. Moore, Robert E. Paull, Ray Ming. 2009. Enrichment of a papaya high-density genetic map with AFLP markers.Genome 52(8): 716–725
9.Jianping Wang, Bruce Roe, Simone Macmil, Jan Murray, Haibao Tang, Cuixia Chen, Fares Najar, Graham Wiley, John Bowers, Daniel S. Rokhsar, Matthew E. Hudson, Stephen P. Moose, Andrew H. Paterson,Ray Ming. 2010 Microcollinarity between diploid sorghum and autopolyploid sugarcane genomes.BMC genomics. 11:261
10.Shubing Liu, Shibin Cai, Robert Graybosch, Cuixia Chen, Guihua Bai. 2008 Quantitative trait loci for resistance to pre-harvast sprouting in U.S.hard white winter wheat Rio Blanco.Theor Appl Genet.117 (5): 691-699
11.Shubing Liu, Guihua Bai, 1 Shibin Cai, Cuixia Chen.2010. Dissection of genetic components of preharvest sprouting resistance in white wheat.Molecular Breeding (In press)
12.Liu Baoshen, Chen Cuixia. 1999 Using Silicon to Enhance Rice Anther Culture. Chinese Rice Research Newsletter. 5(2): 8-9
13.陈翠霞,董树亭,王斌, 王振林等。2004不同玉米自交系南方锈病的抗性评价。 作物学报 30(10): 1053-1055
14.陈翠霞,王振林,王 斌等。2003南方玉米锈病抗病基因的定位及不同遗传背景对基因标记的比较分析。遗传学报 30(4): 341-344 (注:本文被评审专家推荐优先发表)
15.陈翠霞,杨典洱, 王斌, 王振林等。2003南方玉米锈病及其抗性鉴定。植物病理学报, 33(1 ): 86-87
16.陈翠霞,杨典洱, 王振林,王 斌等。2002 齐319携带的南方玉米锈病抗性基因的遗传分析。 遗传学报 29(10):903-907
17.陈翠霞,于元杰等。1999 棉花耐盐变异体的RAPD分析及抗盐生理研究。作物学报, 25(5):643-646
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