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微生物学（071005）立足秦巴山区丰富的微生物资源，利用现代生物技术，对珍稀及食药用价值较高的微生物资源进行保育及利用研究，培养具有创新精神，能独立从事科学研究、教学工作的微生物学专门人才。
研究方向一：微生物资源保育与开发研究 结合秦巴山区微生物资源丰富的特点，开展植物内生菌多样性、珍稀食药用菌保育及利用研究。   
研究方向二：微生物代谢活性物质研究 以秦巴山区丰富的植物内生菌为研究对象，以生物工程技术为主要研究手段，开展植物内生菌代谢活性物质研究。