集美大学理学院于2007年获得应用数学二级学科硕士点，2011年获数学一级学科硕士点，在基础数学、计算数学、应用数学、概率论与数理统计和运筹学与控制论五个二级学科方向招收研究生， 2012年获得福建省重点学科建设。2013年开始招收数学教育方向研究生，2016年招收智能信息处理方向研究生。设有1个省部级实验教学示范中心（信息与计算科学）、1个数学与系统科学研究所、1个国际学术审稿中心（集美大学模糊数学审稿中心）、1个研究中心（复杂系统研究中心）。理学院有硕士导师30人，具有博导资格的教师1人。数学一级学科硕士点招收研究生专业方向与研究团队简介如下：

070101 基础数学  
（1）偏微分方程研究团队
成员：潘佳庆教授，吴红霞副教授，詹华税教授
（2）模糊数学及其应用研究团队
成员：黄欢教授，谢加良博士，孔庆钊博士，张东晓博士，赖艺芬讲师

070102 计算数学
偏微分、分数阶微分方程的数值解法研究团队
成员：梁宗旗教授，陈景华副教授，陈雪娟副教授，叶星旸博士，李凤讲师，靳珊讲师

070103 概率论与数理统计
概率论与数理统计研究团队
成员：蔡南莲教授，郑水草副教授，倪文清博士，纪崑博士，潘谜讲师

070104 应用数学
（1）复杂网络分析与控制研究团队
成员：黄振坤教授，宾红华教授，储理才副教授，方聪娜副教授，陈娟讲师，陈超讲师，邱秀亮讲师，舒明春讲师
（2）生物数学研究团队
成员：魏春金教授，张树文教授，黄龙光教授，王凤筵副教授

070105 运筹学与控制论
组合与图论研究团队
成员：晏卫根教授，陈海燕教授，徐丽琼副教授，林晓霞副教授，林泓副教授，林丽双副教授，曹月芬副教授，林志聪博士，王洪波博士


070106 数学教育  
团队成员：晏卫根教授，宾红华教授，黄振坤教授，刘小辉副教授，张树文教授，朱福胜副教授

070107 智能信息处理
智能信息处理是数学一级学科硕士点下自设的二级点，2016年开始招生。
主要硕士生导师：宾红华教授，黄振坤教授，黄欢教授，吴云东教授，蔡国榕副教授，谢书童副教授，余元辉副教授。