甘肃农业大学兽医学科源自1946年成立的国立兽医学院，1946年招收培养本科生，1953年招收培养硕士研究生，1984年招收培养博士研究生。2002年获得一级学科授权，2003年获批兽医学博士后科研工作流动站，2000年和2007年分别获得兽医硕士和兽医博士专业学位授权。2002年兽医学一级学科获得甘肃省重点学科，2017年获得甘肃省特色学科。
本学科现有专任教师53人，其中教授17人（二级教授3人），研究员1人，副教授22人，高级实验师（兽医师）6人。博士研究生导师16人，硕士研究生导师43人。专任教师中有国家“百千万人才工程”第一、二层次人选2人，国务院学位委员会学科评议组成员1人，教育部动物医学专业教学指导委员会委员1人，国务院兽医专业学位教学指导委员会副主任委员1人，国家级“突出贡献专家”1人，全国“优秀教师”1人，甘肃省第一层次“领军人才”3人，甘肃省“飞天学者”特聘教授2人，甘肃省“333”科技人才和“555”创新人才工程第一、二层次人选5人，甘肃省“高校跨世纪学科带头人”3人，国家教委“霍英东基金会奖励”获得者 3人，甘肃省“高校青年教师成才奖”获得者6人，甘肃省“教学名师”2人，甘肃省“园丁奖”获得者1人。有1个国家级“教学团队”和1个甘肃省“教学团队”。有“甘肃省牛羊胚胎工程技术研究中心”、“甘肃省动物医学实验教学示范中心”以及“兽医学科研创新公用平台”和动物医院。万元以上仪器设备240多台（套），仪器设备总价值2300多万元。
本学科下设基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学和动物医学工程4个二级学科，形成了动物形态学、动物发病机理与病理学诊断、动物病原分子生物学与疫病防控、兽医公共卫生与食品安全、动物生殖机能与调控、动物营养代谢病与中毒病、中药作用机理与中西兽医结合防治畜禽疾病、青藏高原特色动物遗传改良与高效生态繁育等研究方向。培养全日制本科生4500余名，硕士研究生1300名，博士研究生300名。恢复高考后，培养出了中国科学院院士尚永丰、陈化兰等一大批专家学者，并为甘肃省、市、县、乡提供了70%以上的兽医管理与技术骨干。动物医学专业获得国家级“特色专业”、国家级“本科专业综合改革试点”和国家级“卓越农林人才培养模式改革试点”，建有1门国家级精品资源共享课、1门国家级精品课程、6门省级精品课程，获得1项国家级教学成果二等奖、2项甘肃省教学成果一等奖。学科团队结合“高寒旱”地域特色和西部特有动物资源优势，围绕生态健康养殖、动物疫病防控、动物性食品安全与环境安全等，开展科技创新活动。2010年以来，主持国家“863”专项、国家科技支撑计划、国家自然科学基金等项目近40项，省部级及横向项目100余项，获得甘肃省“科技技术奖”、甘肃省“科技进步奖”等奖项10余项，授权专利10余项，发表科研论文1000余篇，其中SCI论文200余篇，尤其在国际顶级学术刊物Science上发表论文2篇，主（副主）编教材、专著40余部。依托青藏高原特色动物高效生态繁育创新团队，国家现代农业产业技术体系肉牛牦牛体系疾病防控研究室传统中兽医兽药防治团队、甘肃省草食畜产业技术体系牛羊疫病防控技术团队、“三区”人才项目及“专家院”，大力推广牦牛遗传改良技术和动物疾病防治技术，每年培训基层兽医和农牧民1500余人次。