机械工程系是机电工程学院的核心专业系部之一，拥有专业教师16人，其中教授2人（含教授级高级工程师1人），副教授8人，讲师6人。负责机械设计制造及其自动化、机械电子工程两个本科专业和机械制造与自动化专科专业的教学和建设工作。与长春合心机械制造有限公司、吉林省东元精密机械有限公司、大象汽车设计有限公司等多家企业签订了校企协同育人协议，建立了稳定的合作关系。
 
机械设计制造及其自动化专业为国家级特色专业建设点、省级特色专业、吉林省人才培养模式改革试验区、教育部卓越工程师教育培养计划实施专业、吉林省品牌专业、吉林省特色高水平专业A类专业；在2017年吉林省专业综合评价中机械设计制造及其自动化专业在吉林省高校专业排名中位于第三位。机械设计制造及其自动化专业教学团队为吉林省优秀教学团队，吉林省科技创新团队。
 
经过多年的办学积淀，机械工程系构建了一套完善的人才培养体系，在教学实践和研究中成果丰硕，为国家经济建设培养了大批高素质应用型人才，办学水平和毕业生综合素质能力得到社会、行业和企业的广泛认可。